本校は、明治８年９月２３日に廃寺を使用し、蔵持小学簡易授業所として創立しました。のちの明治２５年８月に蔵持尋常小学校と改称し、明治４２年３月３０日、現在地に移転改築とともに、創立記念日を４月２２日に変更しました。昭和２２年４月に、名張町立蔵持小学校と改称し、さらに、昭和２９年３月３１日に、市制実施にともない名張市立蔵持小学校と改称し現在に至っています。昭和４０年４月より、桔梗が丘団地児童の通学が始まりました。その後、桔梗が丘小学校完工にともない本校より分離しました。昭和４７年８月１８日旧校舎解体作業が始まり、９月２１日に完了し、校舎の一部は、愛知県犬山市の明治村に移転・保存されています。令和７年度、創立１５０周年をむかえます。